La MFI-SSAM est gérée par un conseil d'administration constitué de 30 représentants des mutuelles, et assure la gestion de services de soins et d'accompagnement mutualistes.
Elle a fait le choix d'intervenir dans tous les domaines ayant une incidence sur la santé, qu'il s'agisse de l'environnement (logement), de la qualité de l'offre de soins avec Priorité santé Mutualiste, de l'accompagnement des personnes âgées, et des personnes en situation de handicap.
Le partenariat est un élément fondamental de sa politique et c'est avec les associations (familles, usagers, professionnels) et les collectivités territoriales que sont élaborés les projets dans les différents secteurs où elle intervient : gérontologie, handicap, insertion, logement, secteur sanitaire.
Les structures gérées répondent aux besoins des usagers mais à travers les pratiques des différents établissements, participent à l'élaboration de la politique du mouvement mutualiste dans ces secteurs, donnant ainsi à la Mutualité toute sa légitimité auprès des pouvoirs publics.